基于线粒体Cytb序列的3个宽体金线蛭群体遗传多样性分析

更新时间:2023-05-28

【摘要】对江苏省扬州高邮、苏州张家港、泰州海陵3个地区宽体金线蛭自然群体的线粒体Cytb基因全序列进行了测定和分析。结果显示:宽体金线蛭Cytb基因全长1 146 bp,样本的A、G、T、C平均含量分别为27.57%、15.77%、43.49%、13.17%,A+T含量（71.06%）明显高于G+C含量（28.94%）。在77个宽体金线蛭样本中,共检测到96个多态位点,其中有58个简约信息位点,获得47个单倍型,共享单倍型数目1个。3个宽体金线蛭群体的平均单倍型多样性、核苷酸多样性、平均核苷酸差异数分别为0.9781、0.0133、15.20,其中泰州海陵群体的单倍型多样度（0.987 7）和核苷酸多样度（0.013 1）最高。3个群体间的遗传分化指数Fst为0.065 1～0.175 6,且差异显著（P<0.05）,不同群体间存在一定的遗传分化。分子方差分析（AMOVA）表明,11.13%的变异来自群体间,88.87%的变异来自群体内。用邻接法构建的单倍型系统发育进化树显示,不同地理群体的个体呈交错分布,没有形成明显的地理谱系。中性检验和核酸不配对分布结果表明,3个宽体金线蛭野生群体总体大小保持相对稳定,没有发生明显的种群扩张。

【关键词】 宽体金线蛭 Cytb 遗传多样性

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